动物疫病分子生物学诊断实验室是2012年学院投资100余万元打造的重点实验室，实验室依托于咸阳职院畜牧兽医研究所。实验室立足于动物重大疫病预防控制的前沿问题以及为畜牧生产提供动物疫病快速诊断和检测服务。目标是将实验室建成西北地区检测技术一流、高度知名的诊断中心，同时在诊断试剂、疫苗开发等应用研究上形成自己的特色和优势。
实验室目前已经开发出了猪瘟、伪狂犬和新城疫3个重大动物疫病鉴别诊断试剂盒，并取得了国家发明专利授权。先后建立了29项快速诊断技术，为临床诊断服务提供了有力的技术支撑。在鸡群新发传染病“心包积液-肝炎综合征”疫苗的研究上获得了阶段性成果。
实验室人才队伍培养成绩显著，目前拥有“咸阳市猪群重大疫病快速诊断技术科技创新团队”1支，博士4人，硕士3人。4年来，实验室立项陕西省科技攻关项目2项，咸阳市科技计划项目3项，学院重点科研项目10余项。实验室先后获得咸阳市科学技术奖二等奖、三等奖各1项，咸阳职业技术学院科研一等奖、二等奖各1项。
实验室设备先进，核心设备全部为原装进口，如美国ABI公司PCR仪、德国SIGMA高速冷冻离心机、美国BIO-Tek酶标仪、英国Syngene 公司全自动凝胶成像系统、日本奥林巴斯荧光显微镜和美国SHELLAB公司CO2培养箱等，为实验研究提供了优良条件。
按照实验室建设规划，动物疫病分子生物学诊断实验室全体人员奋发图强，积极进取，始终坚持“应用研究立足社会需求”的方针，以“创建一流诊断中心，做出一流科研成果”为目标，建成能为地区经济发展做出重要贡献的重点实验室。
